Dịch
$ {alt}
Bởi Michael Haederle

Thám tử bộ gen

Các nhà khoa học UNM nghiên cứu các biến thể của Coronavirus để tìm manh mối về điều gì sẽ xảy ra tiếp theo

Như coronavirus mới - được các nhà khoa học gọi là SARS-CoV-2 - sao chép, các biến thể xuất hiện trong mã di truyền của nó. Tích lũy theo thời gian, những thay đổi này giống như dấu vân tay, để lại dấu vết đáng kể về manh mối về nơi virus đã ở và nơi có thể tấn công.

Các nhà khoa học của Đại học New Mexico Darrell L. Dinwiddie, Tiến sĩ và Daryl Domman, Tiến sĩ, là đóng vai các thám tử bộ gen cố gắng phá án.

Họ là một phần của một hiệp hội quốc gia mới được thành lập gồm các trường đại học nghiên cứu và các sở y tế công cộng đang tìm cách theo dõi căn bệnh này. Được đặt tên là SARS-CoV-2 SPHERES, chương trình được tài trợ bởi Trung tâm Quốc gia về Các bệnh Truyền nhiễm Động vật và Mới nổi (một chi nhánh của Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh) như một cách để thu thập thông tin quan trọng về vi rút.

Dinwiddie, một trợ lý giáo sư tại Khoa Nhi UNM, đã giải trình tự hàng trăm mẫu coronavirus thu được từ Bộ Y tế New Mexico và Phòng thí nghiệm Y tế Công cộng Wyoming trong phòng thí nghiệm gen phân tử của mình trong vài tuần qua.

Ông nói: “Gần đây chúng tôi đã hoàn thành 48 bộ gen đầu tiên từ New Mexico. "Có dấu hiệu mạnh mẽ rằng phần lớn các ca nhiễm trùng đầu tiên ở bang này liên quan đến việc đi du lịch từ khắp nơi trên thế giới."

Dinwiddie đã cộng tác trong phân tích với Domman, Tiến sĩ, một trợ lý giáo sư tại Khoa Nội. Dinwiddie nói: “Anh ấy làm rất nhiều thứ mà chúng tôi gọi là dịch tễ học bộ gen, và nói thêm rằng Doman có kinh nghiệm theo dõi các đợt bùng phát dịch tả trên khắp thế giới. "Chúng tôi đang sử dụng các phương pháp rất giống nhau để điều tra SARS-CoV-2."

Bộ gen của coronavirus mới được mã hóa trong các sợi của một phân tử gọi là RNA. Những thay đổi nhỏ trong trình tự nucleotide trong sợi cung cấp thông tin về mức độ liên quan chặt chẽ của một mẫu virut này với mẫu virut khác.

Các nhà khoa học như Dinwiddie và Domman đang nỗ lực xây dựng thư viện các mẫu này để tạo ra cây họ virus.

Một phân tích sơ bộ về các mẫu thu được ở New Mexico cho thấy đã có nhiều đợt xâm nhập của vi rút vào tiểu bang, điều này phù hợp với các báo cáo ban đầu về các trường hợp ở những người đã đi du lịch nước ngoài hoặc trong nước.

Ông nói: “Chúng tôi cũng có thể nói rằng từ phân tích bộ gen ban đầu, phần lớn các mẫu giống với các chủng đến từ Châu Âu hoặc New York. "Chúng tôi không thấy nhiều thứ có liên quan chặt chẽ với những cái ở Trung Quốc."

Sự biến đổi gen trong quá trình sinh sản của virus là một quá trình tự nhiên. Dinwiddie nói: “Đối với SARS-CoV-2 S, tốc độ thay đổi bộ gen khá ổn định. "Chúng tôi biết nó thay đổi nhanh như thế nào. Dựa trên thông tin đó, chúng tôi có thể đưa ra dự đoán về việc các mẫu khác nhau đã đi được bao xa."

Các mẫu virus được lấy từ mẫu ngoáy mũi được thu thập từ những bệnh nhân có kết quả xét nghiệm dương tính với nhiễm coronavirus. Dinwiddie nói rằng chúng được xử lý bằng các quy trình an toàn sinh học và bất hoạt để chúng không còn lây nhiễm nữa.

DANH MỤC: Sự tham gia của cộng đồng, Sức khỏe, Nghiên cứu, Trường Y khoa, Chuyện nổi bật